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はじめまして．東北大院薬に在籍しております山本浩司と申します．最近Yadokariを頻繁に用いるようになった初心者です．
掲題の件にあります特殊位置におけるDisorder解析についてご教示いただけないでしょうか？
溶媒分子(2,2,5,5-tetramethylhydrofuran)が特殊位置に存在し，Disorderしております．通常のDisorder解析は行ったことがあるのですが，特殊位置におけるDisorder解析の場合どのように進めればよいのか，分からず止まっている状態です．測定パラメータは以下です．
空間群：P21/c
格子定数：a = 10.45, b = 30.09, c = 10.81, alpha = 90deg, beta = 113.205deg, gamma = 90deg
Z value = 4なお，対称性をP21 (Z value = 2)に下げて解析を進めた場合，上記の特殊位置の問題は回避できるのですが，最終構造において一部が負の温度因子を示しました．
お忙しいところ恐縮ですが，特殊位置におけるDisorder解析についてご教示頂けると幸いです．
よろしくお願い致します．- 返事が遅くなりすみません。
一般的に、特殊位置上の分子を取り扱う場合、対称要素によって重なる原子につきましては、占有率を下げて合計の占有率が１になるようにして取り扱います。
たとえば、鏡面上にある原子、ないし、鏡面によって近接する原子については、占有率を 0.5 に固定とすることで、取り扱うことが可能になります。
また、必要に応じて、一部の原子座標も固定する必要があるかと思います。
Nemo 
2013/07/29(Mon) 11:20
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